代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
组分检测：消化吸收组学水平设备是也应该对中医中的化学上工业组分进行推进改革进行分析，检测出中草药材中的活力氧组分。假如，用对于质谱（MS）的消化吸收组学水平设备，也应该检测出长白山人叁中的长白山人叁皂苷等活力氧组分。这般水平设备还也应该划分药用价值价值和非药用价值价值局部的化学上工业标上物，为中医的安全性能操控能提供通过。
线水平掌握：实现新陈排泄组学水平，还不错对中草药的线水平开展测评和掌握。举例，运用值物新陈排泄组学具体分析，还不错的开发针对于类类风湿性环节炎的中草药材质的线水平标志的降钙素原检测策略。除此以外，新陈排泄组学还还不错辨别中草药中的渗透性材质还有其渗透性体系，如实现UPLC-Q-TOF-MS论述，判别差异乌头值物的普通机械材质，并辨别具备有止痛活性酶类和急性膀胱渗透性的菌物碱。
2. 中药药效机制研究
使用靶点甄别：新陈代谢组学系统需要帮甄别西药可溶性材料的团伙靶点。假如，分析察觉到雷公藤红素可确认调高Treg/TH1和Treg/Th17不平衡量、中医NF-κB径路等长效机制利用免疫抑制使用。
功效管理体制阐述：分泌组学技巧也可不可以揭露中医材医疗常见疾病的功效管理体制。列如 ，科研看见青蒿素抗药性与疟原虫的线粒体分泌转变有关于，非靶向药物分泌组学揭露了与该时候相关内容的分泌物转变 规律。最后，分泌组学还可不可以采用概述分泌物的转变 规律，科研中医材复方的功效管理体制。
3. 中药安全性评价
致毒工作工作机制化论述：新陈分解转化组学技術能够用来论述中药才的致毒工作工作机制化。举例子，在新陈分解转化组学和16S rDNA测序的结合分享，阐述了清益汤对病情比较重的时候慢性胰腺炎一些慢性肺影响的爱护工作工作机制化，并设定了铁镇定自若、区别新陈分解转化物和微生物学体菌群彼此的感情。
健康性测评：分解组学系统还能能主要用于成药的健康性测评，认别隐藏的的致毒的成分和致毒靶点，故而为成药的健康实用出示生物学原则。
4. 中医证候研究
证候涉及细胞细胞排泄物深入分析：细胞细胞排泄组学技艺可能在表现与中医学药学证候涉及的内源性细胞细胞排泄物变化无常，铺助中医学药学证候的测试和纠正。举个例子，用细胞细胞排泄组学钻研，已在冠相思病爱美者中鉴定会出与痰瘀证和和气气阴两虚证涉及的生态学标签物。
证候认知深入介绍：发生组学技術同时也可以应使用在深入介绍西药对中医妇科证候的认知效果好。举例，要 发生组学技術及聚类算法介绍法，发觉“黄芪-茯苓-泽泻”等同步药剂加装适应使用在肾病综和征的新组方药剂，要对多类肾病综和征涉及到的的生物工程标制物发生不良影响。
5. 多组学技术整合应用
两组学兼容合并：代谢率组学与某个组学科技（如基因组组学、转录组学、蛋清质组学等）的兼容合并用途，为草药实验出具新一个多角度的浅析框架图。各种兼容合并用途不单增加了.我对草药含量在团伙表层上对人体内身理和方面的问题工作状态的关系，而为反映草药的功效考核机制和效果物基础性出具了强有劲的的工具。
慢性病控制管理制度化：两组学方法可以使用研究方案中成药控制慢性病的碳原子管理制度化。举例说明，使用核核苷酸组学和新陈代谢率组学的携手广泛应用，蕴含了与中医学分级的膝依然能骨性依然能炎密切联系相关内容的文化差异描述核蛋白酶和新陈代谢率环路。
代谢率组学新技术在中西药材茶调查中的利用，为中西药材茶的当今化和精准扶贫整形给予了为重要的科学课搭载，利于深入推进中西药材茶的规范规范和国际上化发展壮大。